Регистрация дохода самозанятым задним числом

Да, может. Однако следует понимать, что это может вызвать перерасчет налоговых обязательств за предыдущие периоды. Если «самозанятый» налогоплательщик отражает свой профессиональный доход, который получен через агентов до 9-го числа текущего месяца за предыдущий месяц, то отражать его необходимо последним числом предыдущего месяца.
Источник:Часть 2 статьи 14 Федеральный закон от 27.11.2018 №422-ФЗ «О проведении эксперимента по установлению специального налогового режима «Налог на профессиональный доход»